Внутрішні та зовнішні біологічні ритми відрізняються причиною. Внутрішні ритми пов'язані зі змінами у функціонуванні органів і їх систем. Зовнішні біоритми пов'язані з процесами у навколишньому середовищі. Біологічний годинник – молекулярна система, у якій концентрація речовин коливається з певним періодом, призводячи до фізіологічних змін в організмі.