Капсула або слизовий шар — гумоподібний або слизоподібний шар, яким вкрита поверхня багатьох бактерій. Функція капсули - допомагає мікроорганізму прикриплятися до поверхонь та в результаті формувати біоплівки або прикріплятися до клітини-хазяїна. Зовнішні структури бактерій: 1 - капсула, 2 - глікокалікс, 3 - біоплівка
Фотосинтетичні мембрани містять пігменти, що поглинають світло (бактеріохлорофіли, каротиноїди). Мезосоми розглядають як ділянки проникнення в клітину трансформувальної ДНК, прикріплення плазмід, місце синтезу екзоферментів, а також як інертне утворення, що виникає за надлишку мембранного матеріалу. Існує припущення, що мезосоми беруть участь у клітинному поділі.