В ході організаційної роботи учнів над веб-квестами реалізуються наступні цілі:
Навчальна — охоплення кожного учня активним пізнавальним процесом. Організація вндивідуальної та групової діяльності учнів, виявлення умінь і здібностей працювати самостійно по темі.
Розвиваюча — розвити інтерес до предмету, творчих здібностей, уяви учнів; формування навичок наукової діяльності, публічних виступів, умінь самостійної роботи з літературою та інтернет-ресурсами; розширення кругозору.
Виховна — виховання толерантності, індивідуальної відповідальності за виконання вибраної роботи.