Задачі з молекулярної біології
Під час розв’язання задач необхідно пам’ятати, що:
довжина одного нуклеотида, L(н) = 0,34 нм;
середня молекулярна маса одного нуклеотида Мr(н) = 345 ;
середня молекулярна маса однієї амінокислоти Мr(а) = 100;
для визначення довжини гена L(гена) або L(ДНК) враховують кількість нуклеотидів, яка міститься в одному ланцюзі ДНК;
для визначення молекулярної маси гена (Mr) враховують кількість нуклеотидів, що міститься у двох ланцюгах ДНК;
для ДНК виконується правило Чаргаффа: А=Т; Г=Ц; А+Г = Т+Ц
сума всіх нуклеотидів в молекулі ДНК або РНК (А+Т+Г+Ц чи А+У+Г+Ц) становить 100%.
Задача 1. Фрагмент першого ланцюга ДНК має таку нуклеотидну послідовність: ТАЦАГАТГГАГТЦГЦ. Визначте послідовність мономерів білка, закодованого фрагментом другого ланцюга ДНК.
Розв’язання
|
ДНК: |
ЦТА |
ТАЦ |
- |
АГА |
- |
ТГГ |
- |
АГТ |
- |
ГЦТ- |
|
|
ГАТ- |
АТГ |
- |
ТЦТ |
- |
АЦЦ - |
ТЦА |
- |
ЦГА- |
|
|
іРНК: |
ЦУА |
УАЦ |
- |
АГА |
- |
УГГ |
- |
АГУ |
- |
ГЦУ- |
|
Білок: |
Лей- |
тир |
- |
арг |
- |
трип |
- |
сер |
- |
ала- |
Відповідь. Послідовність мономерів білка: лейцин- тирозин – аргінін – триптофан – серин – аланін.
Задача 2. Біохімічний аналіз показав, що іРНК має 30% аденіну, 18% гуаніну та 20% урацилу. Визначте частку (у %) кожного нуклеотида у відповідному фрагменті дволанцюгової ДНК?
Розв’язання
Дано: А(іРНК)= 30%; Г (іРНК) = 18%; У(іРНК)= 20%.
А(ДНК)- ? Т(ДНК)- ? Г(ДНК) - ? Ц(ДНК)-? |
Визначаємо відсоток цитозинових нуклеотидів у даній іРНК: Ц(іРНК)=100% - (А+У+Г)=100% - (30% +20% + 18%) =32%. Визначаємо відсоток аденінових і тимінових нуклеотидів (окремо) у фрагменті ДНК: А(ДНК)= Т(ДНК) = (А(іРНК)+У(іРНК)) : 2 = (30% + 20%) : 2 = 25%. Визначаємо відсоток гуанінового і цитозиновог нуклеотидів (окремо) у фрагменті ДНК: Г(ДНК)= Ц(ДНК)= (Г(ДНК)+Ц(ДНК)) : 2 = (18% + 32%) : 2 = 25%.
|
Відповідь. Частка кожного нуклеотида у відповідному фрагменті дволанцюгової ДНК становить 25%.
Задача 3. Біохімічний аналіз показав, що іРНК має 20% аденіну, 30% гуаніну, 40%цитозину та 10% урацилу. Визначте частку (у %) аденіну у відповідному фрагменті дволанцюгової ДНК?
Розв’язання
% |
20 |
- |
30 |
- |
40 |
- |
10 |
іРНК |
А |
- |
Г |
- |
Ц |
- |
У |
ДНК |
Т |
- |
Ц |
- |
Г |
- |
А |
|
А |
- |
Г |
- |
Ц |
- |
Т |
% А(ДНК) = (20 + 10):2 = 15%
Відповідь: частка аденіну у фрагменті дволанцюгової ДНК становить 15%.
Задача 4. На фрагменті одного ланцюга ДНК нуклеотиди розташовані в послідовності, показаній нижче. … АГТАЦГГЦАТГТАГЦ …
1. Напишіть схему структури дволанцюгової молекули ДНК.
2. Якою є довжина цього фрагмента?
3. Якою є маса цього фрагмента ДНК?
Розв’язання
ДНК:
|
|
А |
Г |
Т |
|
А |
Ц |
Г |
|
Г |
Ц |
А |
|
Т |
Г |
Ц |
|
А |
Г |
Ц |
|
|||||
|
| |
| |
| |
|
| |
| |
| |
|
| |
| |
| |
|
| |
| |
| |
|
| |
| |
| |
|
||||||
|
Т |
Ц |
А |
- |
Т |
Г |
Ц |
- |
Ц |
Г |
Т |
- |
А |
Ц |
Г |
- |
Т |
Ц |
Г |
|
2. L(ДНК) = 15 х 0,34 = 5,1 (нм) (15 - кількість нуклеотидів в одному ланцюгу).
3. Мr(ДНК) = 345 х 30 = 10350 (30 – кількість нуклеотидів у двох ланцюгах).
Відповідь. Другий ланцюг фрагмента ДНК має таку структуру: ТЦА – ТГЦ – ЦГТ – АЦГ – ТЦГ ; довжина фрагмента ДНК – 5,1 нм; молекулярна маса фрагмента ДНК –10350 .
Задача 5. Білок складається зі 124 аміноліслот. Порівняйте відносні молекулярні маси білка та гена, який його кодує.Розв’язання
Дано: n(а) = 124 ; Мr(а) = 100; Мr(н) = 345.
Мr(гена) - ? Мr(білка) - ?
|
1). Визначаємо відносну молекулярну масу білка: Мr(білка) = 124 х 100 = 12400. 2). Визначаємо кількість нуклеотидів у складі гена, що кодує даний білок: 124 х 3 х 2 = 744 (нуклеотиди). 3). Визначаємо відносну молекулярну масу гена: Мr(гена) = 744 х 345 = 256 680. 4). Визначаємо, у скільки разів ген важчий за білок: 256 680 : 12400 = 20,7 (рази).
|
Відповідь. Відносна молекулярна маса гена у 20,7 рази більша, ніж кодованого білка.
Задача 6. Гормон росту людини (соматотропін) – білок, що містить 191 амінокислоту. Скільки кодуючих нуклеотидів і триплетів входить до складу гена соматотропіну?
Розв’язання
Одну амінокислоту кодує триплет нуклеотидів (три нуклеотиди)
191 х 3 = 573 (нуклеотиди) – один ланцюг;
573 х 2 = 1146 (нуклеотидів) – обидва ланцюги.
Відповідь. До складу гена соматотропіну входить 191 триплет, що містить 1146 нуклеотидів (обидва ланцюги гена).
Задача 7. У фрагменті одного ланцюга молекули ДНК нуклеотиди розташовані у такій послідовності: ТТГ АГЦ АЦГ ГТА ААТ ЦГА.
Розв'язання
ААЦ ТЦГ ТГЦ ЦАТ ТТА ГЦТ.
2. В одному ланцюгу ДНК 18 пар нуклеотидів, звідси довжина фрагмента ДНК дорівнює:
L (ДНК) = 0,34 х 18 = 6,12 (нм).
3. Молекулярна маса фрагмента ДНК (двох ланцюгів):
Mr (ДНК) = 345 х 18 х 2 = 12420
Відповідь: L (ДНК) = 6,12 (нм) , Mr (ДНК) = 12420