Презентація до уроку: "Практична робота № 1 Розв’язання елементарних вправ зі структури білків та нуклеїнових кислот"

Практична робота № 1 Розв’язання елементарних вправ зі структури білків та нуклеїнових кислот

Пройти тестування з теми «Нуклеїнові кислоти»Повторити основні параметри, які необхідно знати при розв’язуванні задач: Mr амінокислоти, нуклеотиду, довжину нуклеотиди. Навчитися застосовувати правило Чаргаффа при побудові ланцюгів ДНК та РНК. Навчитися обчислювати молекулярну масу ДНК, РНК, білку, довжину гену. Виконати практичну роботу в кінці презентації та надіслати на перевірку. Завдання уроку:

Що необхідно пам’ятати при розв’язку задач? Відносна молекулярна маса (Mr) білків вимірюється в атомних одиницях маси (а.о.м.) або дальтонах (Да) Відносна молекулярна маса амінокислоти – 100 а.о.м. Для розв’язування задач з нуклеїновими кислотами потрібно пам’ятати, що довжина нуклеотиду – 0,34 нм; Молекулярна маса нуклеотиду – 345 а.о.м. Правило Чаргаффа або Принцип комплементарності: кількість аденілових нуклеотидів у молекулі ДНК дорівнює числу тимідилових (А = Т), а гуанілових – числу цитидилових (Г = Ц). Для РНК (А=У, Г=Ц)

Фрагмент одного з ланцюгів ДНК має послідовність нуклеотидів : ТАЦ – ГТЦ – ТГГ – ААТ – ТГА – ТГГ – ТАГ. Яку послідовність має другий ланцюг ДНК? Яка молекулярна маса цієї молекули ДНК? Записуємо 1-ий даний ланцюг:1-ий ланцюг: ТАЦ – ГТЦ – ТГГ – ААТ – ТГА – ТГГ – ТАГВикористовуємо правило Чаргаффа А=Т, Г=Ц та добудовуємо 2-ий ланцюг: АТГ – ЦАГ – АЦЦ – ТТА – АЦТ – АЦЦ – АТЦ Пам’ятаємо, що Мr (нуклеотиду) = 345 а.о.м. Усіх нуклеотидів у молекулі ДНК – 42 Мr (ДНК): 42 нуклеотиди * 345 а.о.м = 14490 а.о.м. Задача №1

На ділянці ДНК, що має послідовність нуклеотидів АТТ – ГЦЦ – ГАТ – ТГГ – ГАА – АЦЦ–ГАТ, синтезується іРНК. Змоделюйте будову молекули іРНК і визначте її довжину? Записуємо ланцюг ДНК: Ланцюг ДНК: АТТ – ГЦЦ – ГАТ – ТГГ – ГАА – АЦЦ – ГАТВикористовуємо правило Чаргаффа А=У, Г=Ц та добудовуємо Ланцюг іРНК: УАА – ЦГГ – ЦУА – АЦЦ – ЦУУ – УГГ – ЦУАУсіх нуклеотидів у ланцюзі РНК – 21 l (нуклеотиду) – 0,34 нм;l (іРНК): 21 нуклеотид * 0,34 нм = 7,14 нм. Задача №2

На ділянці гена, що має послідовність нуклеотидів ЦАЦ – ГТТ – АТА – ТТГ – ГГЦ, синтезується іРНК. Яку послідовність нуклеотидів має іРНК? Як називається процес, внаслідок якого відбувається це подвоєння? Записуємо ланцюг ДНК: Ланцюг ДНК: ЦАЦ – ГТТ – АТА – ТТГ – ГГЦВикористовуємо правило Чаргаффа А=У, Г=Ц та добудовуємо Ланцюг іРНК: ГУГ – ЦАА – УАУ – ААЦ - ЦЦГПроцес: трансляція. Задача №3

Яку кількість амінокислот буде містити в собі білок, який кодується геном, що складається з 1290 нуклеотидів? Яка молекулярна маса даного білку? 3 нуклеотиди кодує - 1 амінокислоту 1290 нуклеотидів кодує - х амінокислот. Х амінокислот = 1290 нуклеотидів * 1 амінокислоту / 3 нуклеотиди = 430 амінокислот Mr 1 амінокислоти - 100 а.о.м. Mr 430 амінокислот – х а.о.м. Х = 430 * 100 а.о.м= 43 000 а.о.м Задача №4

В одному ланцюзі ДНК кількість аденіну становить 10%, тиміну – 46%, гуаніну – 23%, цитозину – 21%. Користуючись правилами Чаргаффа, визначте процентний вміст нуклеотидів у цілій молекулі ДНК. Задача №5{2 D5 ABB26-0587-4 C30-8999-92 F81 FD0307 C}1-ий ланцюг ДНК2-ий ланцюг ДНКА =Т = Г = Ц = 10%46%23%21%= Т= А= Ц= ГВідповідь: Т=10 %, А=46%, Ц= 23%, Г=21%

В одному ланцюзі ДНК кількість аденіну становить 10%, тиміну – 46%, гуаніну – 23%, цитозину – 21%. Користуючись правилами Чаргаффа, визначте процентний вміст нуклеотидів у цілій молекулі ДНК. Задача №5{2 D5 ABB26-0587-4 C30-8999-92 F81 FD0307 C}1-ий ланцюг ДНК2-ий ланцюг ДНКА =Т = Г = Ц = 10%46%23%21%= Т= А= Ц= ГВідповідь: Т=10 %, А=46%, Ц= 23%, Г=21%

У фрагменті одного ланцюга ДНК нуклеотиди розташовані в послідовності: ТТТ–АТГ–ГАТ–ЦАТ. Який буде другий ланцюг? Яка маса цього фрагмента ДНК? Яка довжина цього фрагмента? Записуємо 1-ий даний ланцюг:1-ий ланцюг: ТТТ–АТГ–ГАТ–ЦАТ Використовуємо правило Чаргаффа А=Т, Г=Ц та добудовуємо 2-ий ланцюг: ААА-ТАЦ-ЦТА-ГТА Пам’ятаємо, що Мr (нуклеотиду) = 345 а.о.м. Усіх нуклеотидів у молекулі ДНК – 24 Мr (ДНК): 24 нуклеотиди * 345 а.о.м = 8280 а.о.м.l (нуклеотиду) – 0,34 нм;l (ДНК): 12 нуклеотид * 0,34 нм = 4,08 нм. Задача №6

Фрагмент молекули ДНК містить 560 тимідилових нуклеотидів (28 % загальної кількості). 1. Визначте кількість у даному фрагменті аденілових, гуанілових і цитидилових нуклеотидів.2. Визначте довжину і відносну молекулярну масу цього фрагмента ДНК. За принципом комплементарності, маємо: Т=А=560 нуклеотидів = 28%А+Т+Г+Ц = 100%Визначаємо відсоток Г і Ц – нуклеотидів (кожного окремо, тому ділимо на 2) в цьому фрагменті: Г=Ц =100 % - (А+Т) /2 = 100% - (28+28)/2 = 22%Г=Ц=22%Задача №7

Визначаємо кількість нуклеотидів Г і Ц (кожного окремо) у даному фрагменті ДНК:560 нуклеотидів – 28%Х нуклеотидів – 22% Х = 560*22% / 28% = 440 нуклеотидів. Г=Ц=22%=440 нуклеотидів. L фрагмента: (560 нуклеотидів + 440 нуклеотидів) * 0,34 = 83 776 нм. Мr ДНК(обох ланцюгів, тому множимо на 2): (560*2 + 440*2) * 345 а.о.м = 690 000 а.о.м. Задача №7 (продовження)

Задача №1 (2 бали) Фрагмент одного з ланцюгів ДНК має послідовність нуклеотидів : АЦТ–ТТГ–ГАТ–ГАТ–ТТТ–АЦТ–ГТГ. Яку послідовність має другий ланцюг ДНК? Яка молекулярна маса цієї молекули ДНК? 1-ий ланцюг: : ___ АЦТ–ТТГ–ГАТ–ГАТ–ТТТ–АЦТ–ГТГ ___________2-ий ланцюг: : _________________________________Мr ДНК: _______________________________________Задача №2 (2 бали) На ділянці ДНК, що має послідовність нуклеотидів ЦАЦ – ГТТ – АТА – ТТГ – ГГЦ – ЦАГ – ТАГ – ЦТТ, синтезується іРНК. Змоделюйте будову молекули іРНК і визначте її довжину? Ланцюг ДНК: __ЦАЦ – ГТТ – АТА – ТТГ – ГГЦ – ЦАГ – ТАГ – ЦТТ_Ланцюг іРНК: ______________________L іРНК: ___________________________Практична робота №1 (самостійно)

Задача №3 (2 бали) На ділянці гена, що має послідовність нуклеотидів ЦТЦ–ГТА–ГГЦ–ЦТТ–ААГ, синтезується іРНК. Яку послідовність нуклеотидів має іРНК? Як називається процес, внаслідок якого відбувається це подвоєння? Ланцюг ДНК: ___ ЦТЦ–ГТА–ГГЦ–ЦТТ–ААГ_________Ланцюг іРНК: ________________________Назва процесу: _________________________________Задача №4 (1 бал) В одному ланцюзі ДНК кількість аденіну становить 15%, тиміну – 35%, гуаніну – 23%, цитозину – 27%. Користуючись правилами Чаргаффа, визначте процентний вміст нуклеотидів у цілій молекулі ДНК. Розв’язання:_________________________________________________Відповідь:___________________________________________________

Задача №5 (2бали) У фрагменті одного ланцюга ДНК нуклеотиди розташовані в послідовності: ААТ–ТГТ–ТАЦ–ТТТ. Який буде другий ланцюг? Яка маса цього фрагмента ДНК? Яка довжина цього фрагмента? 1-ий ланцюг: _____ ААТ–ТГТ–ТАЦ–ТТТ ________________2-ий ланцюг: _____________________________________Мr ДНК: _________________________L ДНК: ___________________________________________________Задача №6 (1бал). Яку кількість нуклеотидів буде містити в собі ген, який кодує білок, що складається з 576 амінокислотних залишків? __________________________________________________________

Задача №7 (2 бали)Фрагмент молекули ДНК містить 400 аденілових нуклеотидів (28 % загальної кількості) Визначте кількість у даному фрагменті тимідилових, гуанілових і цитидилових нуклеотидів. Визначте довжину і відносну молекулярну масу цього фрагмента ДНК. Визначте довжину і відносну молекулярну масу цього фрагмента ДНК.